Академик РАН. Лауреат премии Совета Министров СССР. Награжден двумя орденами Трудового Красного Знамени, орденом "Знак Почета"
Юрий Ефремович Нестерихин родился 10 октября 1930 г. в г. Иваново.
В 1953 г. окончил Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова.
В 1954 – 1961 гг. работал в Лаборатории измерительных приборов АН СССР (сейчас НИЦ "Курчатовский институт").
В 1961 г. переведен в Институт ядерной физики СО АН СССР, где работал главным инженером, затем заведующим лабораторией физики плазмы.
В 1967 – 1987 гг. – директор Института автоматики и электрометрии СО АН СССР (ИАиЭ) – головного института по автоматизации научных исследований. Разработчик стандарта "КАМАК", систем компьютерной визуализации "реального времени" для ряда аэрокосмических проектов. Разработал основы эффективных методов диагностики плазмы, сверхбыстродействующие электронно-оптические и лазерные системы для исследования быстропротекающих процессов. На созданных установках были обнаружены и исследованы бесстолкновительные ударные волны в плазме. Принимал участие в создании в Курчатовском институте мощного синхротронного источника "Сибирь-2".
В 1970 – 1980-х гг. под руководством Ю.Е. Нестерихина, А.М. Ковалева, Б.С. Долговесова и Э.А. Талныкина созданы компьютерные системы синтеза визуальной обстановки, которые внедрены в практику отечественного тренажеростроения.
В 1987 – 2010 гг. работал в Институте атомной энергии им. И.В. Курчатова (сейчас НИЦ "Курчатовский институт"). Под руководством Ю.Е. Нестерихина разработаны уникальные мультипроцессорные универсальные рабочие системы обработки больших объемов данных, математическое обеспечение для компьютерной трехмерной томографии.
В 1970 г. избран членом-корреспондентом, а в 1981 г. – действительным членом АН СССР. В 1976-1988 гг. был членом Президиума СО АН СССР, председателем Научного совета Отделения по автоматизации научных исследований, заместителем председателя Научного совета АН СССР по комплексной проблеме "Кибернетика". В 2001-2010 г. – советник РАН.
В 1996 – 2010 гг. – сотрудник Института машиноведения им. А.А. Благонравова (ИМАШ РАН). В 2000-2010 гг. – заведующий созданной им при ИМАШ РАН кафедры "Вычислительные модели технологических процессов" факультета аэрофизики и космических исследований Московского физико-технического института.
В 1988 – 2010 гг. – заведующий кафедрой Московского технического университета связи и информатики.
В 1996 – 2002 гг. – научный руководитель центра "Компьютерные технологии в управлении" в Академии народного хозяйства при правительстве РФ.
В 1969 – 1988 гг. – главный редактор журнала "Автометрия" СО РАН.